Федеральное государственное учреждение «Управление мелиорации земель и сельскохозяйственного водоснабжения по Амурской области» (ФГУ «Управление «Амурмелиоводхоз») создано в результате  реорганизации «Управления по мелиорации земель и сельскохозяйственному водоснабжению Амурской области», путем присоединения к нему федеральных государственных учреждений в качестве филиалов (приказ Минсельхоза Р.Ф. от 27.03.2002г. № 307) :

1. Федеральное государственное учреждение «Белогорское управление по эксплуатации мелиоративных систем»
2. Федеральное государственное учреждение «Свободненское управление по эксплуатации мелиоративных систем»
3. Федеральное государственное учреждение «Амурская гидрогеолого-мелиоративная партия»

17 мая 2011 года,  Федеральное государственное учреждение «Управление мелиорации земель и сельскохозяйственного водоснабжения по Амурской области» (ФГУ «Управление «Амурмелиоводхоз» переименовано в   Федеральное государственное бюджетное  учреждение «Управление мелиорации земель и сельскохозяйственного водоснабжения по Амурской области» (ФГБУ «Управление «Амурмелиоводхоз» (приказ Минсельхоза Р.Ф. от 17.05.2011г.).

С 2021 года в подчинении ФГБУ «Управление «Амурмелиоводхоз» находится  Благовещенский филиал.

Предельная численность ФГБУ «Управление «Амурмелиоводхоз» составляет - 50 человек, штатная - 33 человека.

В целях выполнения государственного задания Учреждение осуществляет следующие основные виды деятельности:

• эксплуатация государственных мелиоративных систем, отдельно расположенных гидротехнических сооружений и другого государственного имущества, переданного Учреждению в оперативное управление;
• определение технического состояния государственных мелиоративных систем и отнесенных к государственной собственности отдельно расположенных гидротехнических сооружений при паспортизации государственных мелиоративных систем и отнесенных к государственной собственности отдельно расположенных гидротехнических сооружений;
• обследование мелиорированных земель в рамках ведения учета мелиорированных земель;
• проведение работ по предупреждению и ликвидации последствий аварий на мелиоративных системах и отдельно расположенных гидротехнических сооружениях;

Так же проводение мероприятий по реализации федеральных целевых программ в сфере мелиорации земель;

ФГБУ «Управление «Амурмелиоводхоз» является членом Ассоциации «Саморегулируемая организация Архитекторов и проектировщиков Дальнего Востока», регистрационный номер 0101-2010-2722080707-П-97 от 18.03.2010 г. и имеет право осуществлять подготовку проектной документации по второму уровню ответственности (стоимость работ по одному договору не превышает 50 000 000,0 (пятьдесят миллионов) рублей).